Rot ist im Bereich des Persischen Golfes eine Flaggenfarbe mit großer Verbreitung. Alle Stämme führten eine rote Flagge. Es war das Abzeichen des Scherifen von Mekka, die allesamt Nachkommen Mohamesd waren. Ausserdem war Rot die Farbe der Charidschiten und Ibaditen, sowie der Nachkommen des Kalifen Ali. Deshalb verwendeten viele arabische Länder eine einfarbige rote Flagge, der Bahrain bis 1819.
1820 schlossen einige Emirate im Bereich des Persischen Golfes einen Allgemeinen Seevertrag mit Großbritannien, welcher die Seeräuberei in dieser Region unterbinden sollte. Als Zeichen der Akzeptanz verpflichteten sich die arabischen Emirate rote Flagge einen weißen Streifen hinzuzufügen, oder ergänzten andere weiße Strukturen, Ränder usw. So trug die Flagge Bahrains ebenfalls einen weißen Streifen in der roten Fahne am Flaggstock. Die heutige Flagge Bahreins basiert auf den Entwurf von 1932. Das rote Flaggentuch wurde durch eine Zickzacklinie vom weißen Streifen getrennt, aber angeblich wird immer noch vereinzelt die alte Version, ohne Zachenstreifen verwendet. 1972 verringerte man die Anzahl der Zacken auf 8. Als der Emir am 22.02 2002 das Königreich Bahrain ausrief wurden die Zackenstreifen nochmals auf 5 Zacken reduziert.