Im Jahre 1925 tauchten erstmals Flaggen auf, die der heutigen sehr ähneln. Bei antifranzösischen Demonstrationen wurden solche Flaggen mitgeführt. Die entgültige Fassung geht auf den Führer der Nationalbewegung Messali Hadj aus dem Jahre 1928 zurück. Er war auch treibende Kraft die verschiedenen Freiheitsbewegungen zur MNA zusammen zu führen.
Mit der Kapitulation der Wehrmacht tauchte die algerische Flagge wieder zu Siegesfeiern auf. Das zeigen der Flagge stand jedoch im damaligen Departement Algerien nach französischem Recht unter Strafe. In der Folge kam es deshalb zu schweren Unruhen, die den algerischen Bürgerkrieg auslösten. Erst durch die Verhandlungen in Evian wurde Algerien am 3.7.1962 unabhängig und die Flagge offiziell eingeführt. Um den Neubeginn zu demonstrieren wurde der französische Mast umgelegt, bevor die Flagge erstmals als Staatsflagge auf Rocher Noir, dem Verwaltungszentrum wehte.
Die Farben haben folgende Bedeutung. Grün ist die Farbe des Islam, Rot drückt den Sozialismus und die Revolution aus. Das Weiß verkörpert die nationale Tradition, Reinheit von Moral und Gesinnung. Die weiße Farbe wird auch mit dem Nationalhelden, Emir Adb-Kader in Verbindung gebracht. Der rote Halbmond bedeutet Glück und ist enger geschlossen, als bei anderen arabischen Ländern.